La structure du Régime Rectifié comporte 9 Grades, qui est divisée en quatre grades maçonniques symboliques, première classe, d'une classe chevaleresque, deuxième classe et d'une classe dite « secrète » qui est la troisième. Le convent des Gaules prit la décision sur suggestion de Jean-Baptiste Willermoz lors de sa 8e séance le 5 décembre 1778, de nommer le 4e grade de l’ancien Écossais vert de la Stricte observance - « maître écossais de Saint André » et de l’intégrer au sein des loges de la classe symboliques.

Le 22 septembre 1816, Jean-Baptiste Willermoz, après avoir reçu à Lyon Rodolphe Salzmann en qualité de Réau ✠ Coën, s’unit à lui pour reprendre et mener à son terme l’œuvre demeurée inachevée depuis 1778 : la rédaction définitive du neuvième grade du Régime Rectifié, le G. P. R. ✠.
Dans le silence du travail intérieur, le Lyonnais et le Strasbourgeois scellèrent alors la structure rituelle et doctrinale de l’ultime degré, dernière clef de voûte de l’édifice initiatique du Régime.

Il est essentiel de rappeler que le G. P. R.✠ n’a aucun lien systémique ni opératif avec le R ✠ du système Coën de Martinez de Pasqually.
Entièrement dépourvu de théurgie et de tout exercice opératif, il se présente comme un rite d’initiation pure, soutenu par une Instruction finale.
Cette Instruction — prolongement direct, organique et nécessaire de celles des Profès et des Grands Profès — a été entièrement rédigée par Jean-Baptiste Willermoz afin de conclure, sceller et sanctifier la doctrine de la Grande Profession, en livrant l’ultime lumière promise depuis l’origine du Régime.

Le Rite Rectifié s'articule de la manière suivante :